Pelagibacter ubique

Pelagibacter ubique

Pelagibacter ubique
Pelagibacter ubique
Classification classique
Règne	Bacteria
Embranchement	Proteobacteria
Classe	Alpha Proteobacteria
Ordre	Rickettsiales
— non-classé —	groupe SAR11
Genre
Candidatus Pelagibacter — auteur incomplet —, date à préciser
Nom binominal
Candidatus Pelagibacter ubique  ?Rappé et al., 2002
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Pelagibacter ubique est une petite alphaproteobacteria hétérotrophe, trouvée dans tous les océans. C'est peut-être la bactérie la plus représentée au monde (peut-être 10²⁸ cellules). Cette bactérie était à l'origine nommée SAR11 et connue seulement grâce à ses ARNr identifiés dans des échantillons de la mer des Sargasses en 1990. La bactérie a ensuite été isolée et décrite en 2002.

Composant du bactérioplancton, Pelagibacter a une distribution mondiale. Très petite, elle a une longueur de 0,37-0,89 µm et un diamètre de seulement 0,12-0,20 µm.

Tout petit, le génome de Pelagibacter est séquencé : il contient 1,3 Mpb et 1 354 gènes. Il n’y a pas d’introns, pas de transposons, pas de pseudogènes, pas d’éléments extragéniques, pas d’intéines et peu de paralogues.

Références

• Michael S. Rappé, Stephanie A. Connon, Kevin L. Vergin, Stephen J. Giovannoni (2002). "Cultivation of the ubiquitous SAR11 marine bacterioplankton clade". Nature 418: 630-633.
• R. M. Morris et al. (2002). "SAR11 clade dominates ocean surface bacterioplankton communities". Nature 420: 806 - 810.
• Stephen J. Giovannoni, H. James Tripp et. al (2005). "Genome Streamlining in a Cosmopolitan Oceanic Bacterium". Science 309: 1242-1245.
• Référence NCBI : Candidatus Pelagibacter (en)
• Référence NCBI : Candidatus Pelagibacter ubique Rappe et al. 2002 (en)

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