Projet de séquençage de génome


Projet de séquençage de génome

Les projets de séquençage de génome sont des projets scientifiques qui ont pour but d'obtenir les séquences complètes des génomes de différents organismes: bactéries, plantes, champignons, animaux, et humain.

Ce travail nécessite la séquence de l'ADN de chacun des chromosomes de l'espèce. Pour une bactérie, il n'y a qu'un seul chromosome à séquencer. Pour l'espèce humaine , qui possède 22 paires de chromosomes et 2 chromosomes sexuels ( X et Y), il y a 24 chromosomes à séquencer.

Le projet génome humain est abouti depuis 2003.

Sommaire

Assemblage génomique

L'assemblage génomique consiste à prendre un grand nombre de séquences d'ADN, qui ont été obtenues par la méthode Whole Genome Shotgun , pour les remettre ensemble et recréer le chromosome original. Dans la méthode Whole Genome Shotgun , l'ADN d'un seul organisme est fragmenté en millions de morceaux. Ceux-ci sont lus par des séquenceurs d'ADN automatiques (qui peuvent déterminer 900 bases par minutes). Les quatre bases sont adénine, guanine, cytosine, et thymine, abrégées AGCT. Un logiciel d'algorithme d'assemblage génomique analyse chaque fragment et les aligne tous les uns derrières les autres, en détectant les zones de chevauchement entre les fragments. Si deux séquences se correspondent elles sont considérées comme étant identiques ce qui relie les fragments.

L'assemblage génomique peut être problématique pour les informaticiens, car les génomes contiennent des séquences qui se répètent, et ces répétitions peuvent être longues de plusieurs milliers de nucléotides (ou bases) et sur plusieurs endroits du génome. C'est surtout le cas pour les grands génomes des plantes et des animaux.

Exemples de projets

Articles détaillés : Liste d'espèces dont le génome est séquencé, Liste d'espèces archéeenes dont le génome est séquencé, Liste d'espèces eubactériennes dont le génome est séquencé et Liste d'espèces eucaryotes dont le génome est séquencé.
La drosophile, un des organismes supérieurs à voir son génome entier séquencé.
Lepoisson zèbre, un autre organisme modèle
Le International Grape Genome Program a pour but la maîtrise de la qualité des vins.

De nombreux organismes sont le sujet de projet de séquençage de génome, déjà abouti ou sur le point de l'être:


Vertébrés

Mammifères

Plantes

Autres animaux

Virus, Archées et Eubactéries

Microbiome et Métagénome

Le 11 janvier 2008, le National Institutes of Health lance dans le cadre du NIH Roadmap for Medical Research le en:Human Microbiome Project. Le but de celui-ci est le séquençage, dans un délai de cinq ans, du génome d'un millier de microbiotes de l'homme et l'analyse de leurs rôles dans la santé et les maladies humaines[4].

Le 11 avril 2008 est lancé le projet européen MetaHIT[5].Coordonné par l'INRA, il a pour but d'étudier le génome de l'ensemble des bactéries constituant la flore intestinale humaine afin de caractériser ses fonctions et ses implications sur la santé[6].

Notes

Liens externes



Wikimedia Foundation. 2010.

Contenu soumis à la licence CC-BY-SA. Source : Article Projet de séquençage de génome de Wikipédia en français (auteurs)

Regardez d'autres dictionnaires:

  • Séquençage du génome — Séquençage En biochimie, le séquençage consiste à déterminer l ordre linéaire des composants d une macromolécule (les acides aminés d une protéine, les nucléotides d un acide nucléique comme l ADN, les monosaccharides d un polysaccharide, etc.).… …   Wikipédia en Français

  • Projet Génome Humain — Pour les articles homonymes, voir PGH. Le Projet Génome Humain est un projet entrepris en 1990 dont la mission était d établir le séquençage complet de l ADN du génome humain. Son achèvement a été annoncé en avril 2003[1]. Le génome humain est l… …   Wikipédia en Français

  • Projet du génome humain — Projet génome humain Pour les articles homonymes, voir PGH. Le Projet Génome Humain est un projet entrepris en 1990 dont la mission était d établir le séquençage complet de l ADN du génome humain. Son achèvement a été annoncé en avril 2003[1]. Le …   Wikipédia en Français

  • Projet genome humain — Projet génome humain Pour les articles homonymes, voir PGH. Le Projet Génome Humain est un projet entrepris en 1990 dont la mission était d établir le séquençage complet de l ADN du génome humain. Son achèvement a été annoncé en avril 2003[1]. Le …   Wikipédia en Français

  • Séquençage des génomes — Projet de séquençage de génome Les projets de séquençage de génome sont des projets scientifiques qui ont pour but d obtenir les séquences complètes des génomes de différents organismes: bactéries, plantes, champignons, animaux, et humain. Ce… …   Wikipédia en Français

  • Projet génome humain — Le génome humain est constitué de l ensemble de l information portée par nos 23 paires de chromosomes Le Projet Génome Humain est un projet entrepris en 1990 dont la mission était d établir le séquençage complet de l ADN du génome humain. Son… …   Wikipédia en Français

  • Séquençage en temps réel — 454 Life Sciences Pour les articles homonymes, voir 454 (homonymie). Logo de 454 Life Sciences Création …   Wikipédia en Français

  • Sequencage — Séquençage En biochimie, le séquençage consiste à déterminer l ordre linéaire des composants d une macromolécule (les acides aminés d une protéine, les nucléotides d un acide nucléique comme l ADN, les monosaccharides d un polysaccharide, etc.).… …   Wikipédia en Français

  • Séquençage — En biochimie, le séquençage consiste à déterminer l ordre linéaire des composants d une macromolécule (les acides aminés d une protéine, les nucléotides d un acide nucléique comme l ADN, les monosaccharides d un polysaccharide, etc.). En… …   Wikipédia en Français

  • Génome humain — Génétique humaine La génétique humaine est une branche de la génétique s occupant de l espèce animale Homo sapiens, c’est à dire l Homme, l être humain. Sommaire 1 Nombre de chromosomes 2 ADN mitochondrial 3 Nombre de gènes …   Wikipédia en Français


Share the article and excerpts

Direct link
Do a right-click on the link above
and select “Copy Link”

We are using cookies for the best presentation of our site. Continuing to use this site, you agree with this.