Élément SECIS

Variabilité des bases nucléiques sur l'élément SECIS.

Un élément SECIS, de l'anglais selenocysteine insertion structure, est un élément cis-régulateur d'ARN messager long d'une soixantaine de nucléotides caractérisé par sa forme en épingle à cheveux, ou « tige-boucle ». Cette structure tridimensionnelle particulière conduit les ribosomes à traduire le codon UGA par un acide aminé, la sélénocystéine, alors qu'il s'agit normalement du codon-STOP Opale dans le code génétique. Les éléments SECIS sont donc indispensables à la synthèse des sélénoprotéines, essentiellement des enzymes de la famille des oxydo-réductases.

Chez les bactéries, les éléments SECIS apparaissent peu après les codons UGA dont ils altèrent la traduction. Chez les archées et chez les eucaryotes, ils se trouvent dans la région 3'-terminale des ARN messagers et peuvent affecter le sens de plusieurs codons UGA. L'un de ces éléments SECIS se trouve dans la région 5'-terminale chez Methanococcus, du phylum des Euryarchaeota.

La structure secondaire particulière des éléments SECIS découle d'une séquence de bases nucléiques présentant certaines caractéristiques distinctives autorisant cette configuration spatiale déterminante, notamment des appariements atypiques entre paires de bases puriques — guanine et adénine — qui sont essentiels au bon fonctionnement de l'élément SECIS.

Articles connexes

• Élément PYLIS, relatif à la pyrrolysine.

Liens externes

• (en) R Walczak, E Westhof, P Carbon et A Krol, « A novel RNA structural motif in the selenocysteine insertion element of eukaryotic selenoprotein mRNAs », dans RNA, vol. 4, 2 avril 1996, p. 367-379 [texte intégral (page consultée le 2 janvier 2011)] 
• (en) André Lambert, Alain Lescure et Daniel Gautheret, « A survey of metazoan selenocysteine insertion sequences », dans Biochimie, vol. 84, n^o 9, septembre 2002, p. 953-959 [texte intégral (page consultée le 2 janvier 2011)] 
  DOI:10.1016/S0300-9084(02)01441-4 PMID : 12458087.
• (en) Heiko Mix, Alexey V. Lobanov et Vadim N. Gladyshev, « SECIS elements in the coding regions of selenoprotein transcripts are functional in higher eukaryotes », dans Nucleic Acids Research, vol. 35, n^o 2, 14 décembre 2006, p. 414-423 [texte intégral (page consultée le 2 janvier 2011)] 
  DOI:10.1093/nar/gkl1060 PMID : 17169995
• (en) A. Cassago, E.M. Rodrigues, E.L. Prieto, K.W. Gaston, J.D. Alfonzo M.P. Iribar, M.J. Berry, A.K. Cruz et O.H. Thiemann, « Identification of Leishmania selenoproteins and SECIS element », dans Molecular and Biochemical Parasitology, vol. 149, n^o 2, octobre 2006, p. 128-134 [texte intégral (page consultée le 2 janvier 2011)] 
  DOI:10.1016/j.molbiopara.2006.05.002 PMID : 16766053
• (en) Tobias Mourier, Arnab Pain, Bart Barrell et Sam Griffiths-Jones, « A selenocysteine tRNA and SECIS element in Plasmodium falciparum », dans RNA, vol. 11, n^o 2, 2005, p. 119-122 [texte intégral (page consultée le 2 janvier 2011)] 
  DOI:10.1261/rna.7185605 PMID : 15659354
• (en) Gregory V. Kryukov, Sergi Castellano, Sergey V. Novoselov, Alexey V. Lobanov, Omid Zehtab, Roderic Guigó et Vadim N. Gladyshev, « Characterization of Mammalian Selenoproteomes », dans Science, vol. 300, n^o 5624, 30 mai 2003, p. 1439-1443 [texte intégral (page consultée le 2 janvier 2011)] 
  DOI:10.1126/science.1083516 PMID : 12775843
• (en) Gregory V. Kryukov et Vadim N. Gladyshev, « The prokaryotic selenoproteome », dans EMBO reports, vol. 5, n^o 5, 23 avril 2004, p. 538-543 [texte intégral (page consultée le 2 janvier 2011)] 
  DOI:10.1038/sj.embor.7400126 PMID : 15105824
• (en) Alain Krol, « Evolutionarily different RNA motifs and RNA–protein complexes to achieve selenoprotein synthesis », dans Biochimie, vol. 84, n^o 8, août 2002, p. 765-774 [texte intégral (page consultée le 2 janvier 2011)] 
  DOI:10.1016/S0300-9084(02)01405-0 PMID : 12457564